Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

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Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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