Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms