Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRKCDQ05655 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms