Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CENPEQ02224 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms