Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DEFA5Q01523 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms