Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1BQ00975 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms