Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC5Q00444 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXC5Q00444 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms