Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TUBB4BP68371 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBB4BP68371 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms