Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ERVS71-1P61550 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ERVS71-1P61550 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms