Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERFP50548 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERFP50548 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERFP50548 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms