Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NUP153P49790 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP153P49790 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP153P49790 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP153P49790 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP153P49790 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP153P49790 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP153P49790 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP153P49790 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP153P49790 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP153P49790 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP153P49790 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP153P49790 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP153P49790 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP153P49790 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP153P49790 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP153P49790 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP153P49790 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP153P49790 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP153P49790 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP153P49790 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP153P49790 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP153P49790 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP153P49790 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP153P49790 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP153P49790 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP153P49790 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP153P49790 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP153P49790 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP153P49790 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP153P49790 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP153P49790 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP153P49790 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP153P49790 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP153P49790 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP153P49790 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP153P49790 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP153P49790 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP153P49790 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP153P49790 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP153P49790 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP153P49790 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP153P49790 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP153P49790 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP153P49790 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP153P49790 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP153P49790 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP153P49790 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP153P49790 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP153P49790 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP153P49790 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP153P49790 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP153P49790 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP153P49790 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP153P49790 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP153P49790 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP153P49790 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP153P49790 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP153P49790 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP153P49790 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP153P49790 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP153P49790 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP153P49790 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP153P49790 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP153P49790 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP153P49790 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP153P49790 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP153P49790 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP153P49790 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP153P49790 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP153P49790 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP153P49790 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP153P49790 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP153P49790 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP153P49790 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP153P49790 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP153P49790 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP153P49790 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP153P49790 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP153P49790 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP153P49790 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP153P49790 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP153P49790 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP153P49790 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP153P49790 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP153P49790 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP153P49790 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP153P49790 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms