Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms