Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms