Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CT47B1P0C2W7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CT47B1P0C2W7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CT47B1P0C2W7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CT47B1P0C2W7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms