Protein–RNA interactions for Protein: P06396

GSN, Gelsolin, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSNP06396 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSNP06396 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSNP06396 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSNP06396 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSNP06396 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSNP06396 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSNP06396 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSNP06396 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSNP06396 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSNP06396 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GSNP06396 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSNP06396 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSNP06396 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GSNP06396 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSNP06396 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSNP06396 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSNP06396 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSNP06396 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSNP06396 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSNP06396 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSNP06396 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSNP06396 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSNP06396 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSNP06396 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSNP06396 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSNP06396 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSNP06396 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSNP06396 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSNP06396 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms