Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSTAP01040 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSTAP01040 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSTAP01040 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms