Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APAF1O14727 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APAF1O14727 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APAF1O14727 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APAF1O14727 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APAF1O14727 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APAF1O14727 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APAF1O14727 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APAF1O14727 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APAF1O14727 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APAF1O14727 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APAF1O14727 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APAF1O14727 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APAF1O14727 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APAF1O14727 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APAF1O14727 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APAF1O14727 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APAF1O14727 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APAF1O14727 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APAF1O14727 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APAF1O14727 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APAF1O14727 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APAF1O14727 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
APAF1O14727 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
APAF1O14727 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
APAF1O14727 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
APAF1O14727 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
APAF1O14727 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APAF1O14727 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APAF1O14727 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APAF1O14727 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APAF1O14727 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APAF1O14727 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APAF1O14727 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APAF1O14727 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms