Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms