Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BHMG1C9JSJ3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BHMG1C9JSJ3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms