Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A6NL46 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A6NL46 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A6NL46 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A6NL46 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A6NL46 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A6NL46 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A6NL46 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A6NL46 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A6NL46 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A6NL46 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A6NL46 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A6NL46 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A6NL46 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A6NL46 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A6NL46 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A6NL46 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms