Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC78A2IDD5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms