Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms