Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRA1Q9HD15 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRA1Q9HD15 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRA1Q9HD15 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRA1Q9HD15 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRA1Q9HD15 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRA1Q9HD15 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRA1Q9HD15 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRA1Q9HD15 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms