Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZC3H12CQ9C0D7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZC3H12CQ9C0D7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms