Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
VAT1Q99536 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAT1Q99536 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms