Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2Q99439 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CNN2Q99439 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNN2Q99439 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms