Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRRC1Q96M27 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms