Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CLMNQ96JQ2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CLMNQ96JQ2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms