Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NMD3Q96D46 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms