Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SDE2Q6IQ49 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SDE2Q6IQ49 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SDE2Q6IQ49 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SDE2Q6IQ49 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SDE2Q6IQ49 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SDE2Q6IQ49 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SDE2Q6IQ49 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SDE2Q6IQ49 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SDE2Q6IQ49 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SDE2Q6IQ49 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SDE2Q6IQ49 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SDE2Q6IQ49 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SDE2Q6IQ49 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SDE2Q6IQ49 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SDE2Q6IQ49 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms