Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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FAM78BQ5VT40 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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FAM78BQ5VT40 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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FAM78BQ5VT40 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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FAM78BQ5VT40 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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FAM78BQ5VT40 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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FAM78BQ5VT40 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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FAM78BQ5VT40 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM78BQ5VT40 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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