Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Q5VSD8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q5VSD8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms