Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM164Q5U3C3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms