Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYT6Q5T7P8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYT6Q5T7P8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms