Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY80

CATSPERE, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPEREQ5SY80 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CATSPEREQ5SY80 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CATSPEREQ5SY80 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms