Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF2Q5BJF6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms