Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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RTL8BQ17RB0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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RTL8BQ17RB0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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RTL8BQ17RB0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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RTL8BQ17RB0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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RTL8BQ17RB0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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RTL8BQ17RB0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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