Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6V1FQ16864 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms