Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UPP1Q16831 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UPP1Q16831 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms