Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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HIST2H2BEQ16778 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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HIST2H2BEQ16778 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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HIST2H2BEQ16778 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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HIST2H2BEQ16778 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
HIST2H2BEQ16778 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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