Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HIF1AQ16665 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIF1AQ16665 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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