Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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BRD3Q15059 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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BRD3Q15059 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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BRD3Q15059 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BRD3Q15059 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
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