Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAMK2DQ13557 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms