Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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