Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXD4Q12950 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXD4Q12950 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms