Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LMAN2Q12907 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LMAN2Q12907 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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