Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CNTN1Q12860 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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