Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCK1Q08629 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms