Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ACTBP60709 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ACTBP60709 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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ACTBP60709 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ACTBP60709 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ACTBP60709 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ACTBP60709 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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ACTBP60709 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ACTBP60709 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ACTBP60709 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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ACTBP60709 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ACTBP60709 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ACTBP60709 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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ACTBP60709 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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ACTBP60709 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ACTBP60709 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ACTBP60709 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ACTBP60709 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ACTBP60709 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ACTBP60709 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ACTBP60709 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ACTBP60709 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ACTBP60709 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ACTBP60709 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ACTBP60709 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ACTBP60709 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ACTBP60709 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ACTBP60709 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ACTBP60709 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ACTBP60709 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ACTBP60709 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
ACTBP60709 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ACTBP60709 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ACTBP60709 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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