Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
AQP4P55087 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
AQP4P55087 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
AQP4P55087 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
AQP4P55087 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
AQP4P55087 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
AQP4P55087 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
AQP4P55087 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AQP4P55087 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AQP4P55087 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AQP4P55087 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AQP4P55087 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AQP4P55087 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AQP4P55087 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AQP4P55087 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AQP4P55087 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AQP4P55087 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AQP4P55087 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AQP4P55087 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AQP4P55087 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AQP4P55087 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AQP4P55087 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AQP4P55087 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AQP4P55087 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AQP4P55087 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AQP4P55087 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AQP4P55087 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms